Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Asic2-202ENSMUST00000066197 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 1700069P05Rik-201ENSMUST00000204240 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm16299-201ENSMUST00000162724 2766 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms