Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5218F6YH22 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms