Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9S5

Gm9964, Predicted gene 9964, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9964E9Q9S5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9964E9Q9S5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9964E9Q9S5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms