Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms