Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms