Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc17E9PVB5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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