Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gcn1E9PVA8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gcn1E9PVA8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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