Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Samd1D3YXK1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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