Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17333C6EQI3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms