Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17660B9UIU9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms