Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf11cB4XVP9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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