Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspp1B2RX88 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms