Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clrn2B2RVW2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn2B2RVW2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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