Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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