Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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