Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf1B2RRD7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms