Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prr16A3KMN5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prr16A3KMN5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms