Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam43bA2AM80 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms