Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lcn6A2AJB9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn6A2AJB9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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