Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms