Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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