Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms