Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt27Q9Z320 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms