Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac6Q9Z2V5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms