Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ubl3Q9Z2M6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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