Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms