Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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