Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms