Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ilf3Q9Z1X4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ilf3Q9Z1X4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ilf3Q9Z1X4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ilf3Q9Z1X4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ilf3Q9Z1X4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms