Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gdf11Q9Z1W4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf11Q9Z1W4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms