Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam50bQ9WTJ8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam50bQ9WTJ8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms