Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TapbpQ9R233 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TapbpQ9R233 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms