Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf4Q9QZS2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf4Q9QZS2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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