Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms