Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnt3Q9QZ47 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms