Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms