Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SacsQ9JLC8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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SacsQ9JLC8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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SacsQ9JLC8 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SacsQ9JLC8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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