Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gde1Q9JL56 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms