Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms