Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ybx3Q9JKB3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms