Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Rb1cc1Q9ESK9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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