Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp29Q9ES63 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp29Q9ES63 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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