Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3bQ9ES34 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3bQ9ES34 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3bQ9ES34 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3bQ9ES34 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube3bQ9ES34 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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