Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms