Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms