Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms