Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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