Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd9Q9D9M4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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