Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam3aQ9D8T0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms