Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms